水産資源を持続的により良く利用するためには、漁業対象の魚種だけではなく、漁業の対象とされない魚種やそれら魚種を支える食物連鎖の底辺までの、生態系全体の構造と変動機構を理解することが求められています。
高温で生産性の高い黒潮生態系は、黒潮域の魚類だけではなく冷水域に回遊する魚類の産卵場や成育場として好適なため、日本の漁業生産とその変動の鍵となる海域です。しかし、黒潮域における生態系の仕組みには不明な点が多く、生態系に基づく水産資源利用手法確立の障害となっています。
そこで、黒潮生態系の構造と機能を明らかにし、環境変動に対する応答を理解することにより、生態系の総合的な生産力の活用を図る黒潮生態系変動研究（The Study of Kuroshio Ecosystem Dynamics for Sustainable Fisheries: SKED）」を実施します。この目標達成のため、海洋物理・化学・生物および生態系モデルの専門家集団により、研究船および人工衛星による観測と数値モデル実験を併用した統合的海洋研究を実施します。
